本文針對高比例難降解工業廢水處理廠生化系統面臨的挑戰，以中藥成藥生產廢水為研究對象，分析了其廢水特性（如高有機物濃度、生物毒性強、可生化性差等），提出了一種綜合性生化系統升級改造方案。通過優化水解酸化段、引入厭氧-缺氧-好氧組合工藝、添加專屬微生物菌劑及改進回流策略，提升了COD去除率至92%以上，并提高了系統對pH沖擊和毒性物質的耐受性；運用了出水穩定達標與運行能耗之間的平衡點。研究為類似難降解工業廢水的生化系統改造提供了理論和工程實踐參考，尤其適應于中藥廢水規模化、高效化、低碳化治理需求。